Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Mrpl28Q9D1B9 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Mrpl28Q9D1B9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Mrpl28Q9D1B9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Mrpl28Q9D1B9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Mrpl28Q9D1B9 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Mrpl28Q9D1B9 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Mrpl28Q9D1B9 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Mrpl28Q9D1B9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Mrpl28Q9D1B9 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Mrpl28Q9D1B9 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Mrpl28Q9D1B9 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl28Q9D1B9 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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