Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Smim11aQ99J19 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Smim11aQ99J19 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Smim11aQ99J19 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Smim11aQ99J19 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Smim11aQ99J19 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Smim11aQ99J19 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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Smim11aQ99J19 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
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