Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms