Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ufl1Q8CCJ3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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