Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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Ttc28Q80XJ3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Ighv1-86-201ENSMUST00000200562 353 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ttc28Q80XJ3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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