Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Vma21Q78T54 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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