Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rbm27Q5SFM8 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rbm27Q5SFM8 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rbm27Q5SFM8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rbm27Q5SFM8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rbm27Q5SFM8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rbm27Q5SFM8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rbm27Q5SFM8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rbm27Q5SFM8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rbm27Q5SFM8 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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