Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Trappc3lQ4KL14 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms