Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Fchsd2Q3USJ8 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms