Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cers3Q1A3B0 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms