Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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COL9A3Q14050 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
COL9A3Q14050 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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COL9A3Q14050 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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COL9A3Q14050 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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COL9A3Q14050 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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COL9A3Q14050 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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COL9A3Q14050 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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COL9A3Q14050 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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COL9A3Q14050 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
COL9A3Q14050 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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