Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Cnn2Q08093 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Cnn2Q08093 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Cnn2Q08093 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Cnn2Q08093 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Cnn2Q08093 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
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