Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp9xP70398 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Usp9xP70398 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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