Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
RhobP62746 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
RhobP62746 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
RhobP62746 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms