Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
ThpoP40226 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ThpoP40226 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
ThpoP40226 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms