Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Hoxc9P09633 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hoxc9P09633 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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