Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Foxq1O70220 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms