Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apol6B7ZC55 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms