Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Spocd1B1ASB6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms