Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtf1A2AQ19 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rtf1A2AQ19 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rtf1A2AQ19 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rtf1A2AQ19 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rtf1A2AQ19 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rtf1A2AQ19 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rtf1A2AQ19 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rtf1A2AQ19 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rtf1A2AQ19 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rtf1A2AQ19 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rtf1A2AQ19 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms