Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Col4a3Q9QZS0 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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Col4a3Q9QZS0 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Col4a3Q9QZS0 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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