Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gtf2e1Q9D0D5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gtf2e1Q9D0D5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms