Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms