Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Klc3Q91W40 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Klc3Q91W40 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms