Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Dnajc28Q8VCE1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Dnajc28Q8VCE1 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Dnajc28Q8VCE1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Dnajc28Q8VCE1 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Dnajc28Q8VCE1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Dnajc28Q8VCE1 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Dnajc28Q8VCE1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Dnajc28Q8VCE1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Dnajc28Q8VCE1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Dnajc28Q8VCE1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dnajc28Q8VCE1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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