Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxc12Q8K5B8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms