Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab11fip3Q8CHD8 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11fip3Q8CHD8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Rab11fip3Q8CHD8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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