Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pramef8Q8CE24 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pramef8Q8CE24 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Pramef8Q8CE24 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pramef8Q8CE24 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms