Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Ccdc88cQ6VGS5 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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