Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSSK4Q6SA08 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms