Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Sbno1Q689Z5 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms