Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Trim28Q62318 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trim28Q62318 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms