Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV77

Ggnbp2, Gametogenetin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggnbp2Q5SV77 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ggnbp2Q5SV77 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms