Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
E130208F15RikQ3UPV3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms