Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ALX1Q15699 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms