Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rpusd2Q149F1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rpusd2Q149F1 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Rpusd2Q149F1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
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Rpusd2Q149F1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Rpusd2Q149F1 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rpusd2Q149F1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Rpusd2Q149F1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Rpusd2Q149F1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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