Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ttc21bQ0HA38 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ttc21bQ0HA38 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms