Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm7069-201ENSMUST00000182418 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacna1sQ02789 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms