Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cacna1cQ01815 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms