Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Col1a2Q01149 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms