Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gjb2Q00977 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms