Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tmod1P49813 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tmod1P49813 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Tmod1P49813 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tmod1P49813 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tmod1P49813 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tmod1P49813 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tmod1P49813 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
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Tmod1P49813 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tmod1P49813 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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