Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
TtlP38585 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
TtlP38585 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TtlP38585 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms