Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab5cP35278 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms