Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
P18530 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
P18530 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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