Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cfap46E9Q2C0 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cfap46E9Q2C0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms