Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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