Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Cldn6Q9Z262 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
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Cldn6Q9Z262 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Cldn6Q9Z262 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Cldn6Q9Z262 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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