Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trip6Q9Z1Y4 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms