Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Csnk1eQ9JMK2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Csnk1eQ9JMK2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Csnk1eQ9JMK2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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